X-Men 5 (Birinci Sınıf), adından da anlaşılacağı gibi, bu film Profesör Xavier'in mutant okulunda verilen ilk dersin hikayesini anlatıyor. 1960'larda: Yirmili yaşlarında, gür saçlı ve filmin başında henüz tekerlekli sandalyede olmayan genç Profesör Charles Xavier (James McAvoy) Oxford'da okumaktadır ve kendisiyle aynı yaşta olan Erik Lensherr (Michael Fassbender) ile tanışır. Her ikisi de olağanüstü yeteneklere sahip mutantlardır. Birlikte mutantların ve insanların bir arada yaşayabileceği bir gelecek hayal ederler. Dünyanın refahı tehlikeye girdiğinde, Emma Frost (January Jones) ve Sebastian Shaw (Kevin Bacon) ile birlikte Hellfire Club'ın yakın tehlikesine karşı savaşmak için diğer mutantların yardımıyla güçlerini birleştirirler. Ancak bu savaş sırasında ikisi ezeli düşman haline gelir.
