Top Gun 2: Maverick filminden birkaç yıl sonra, Pete "Maverick" Mitchell, Top Gun Akademisi'nde öğretmen olarak görev yapmaya devam etmektedir. Bir gün, Çin tarafından geliştirilen yeni bir süper uçak, bölgedeki bir uyduyu düşürür. ABD hükümeti, Maverick'ten yeni bir pilot ekibi kurmasını ve uçağı imha etmesini ister.
Maverick, yeni ekibini Top Gun Akademisi'nde eğitmeye başlar. Ekip, Maverick'in sert ve disiplinli yöntemleriyle zorlanır. Ancak, Maverick'in deneyimi ve becerileri sayesinde, ekip kısa sürede uyum sağlar ve uçağı imha etmek için hazır hale gelir.