Kötülük Diye Bir Şey Yok, huzurlu bir Japon köyünde yaşayan bir babanın hayatına odaklanır. Köy, yeni bir inşaat projesiyle karşı karşıya kalır ve bu durum sakin yaşamlarını alt üst eder. Tokyo'dan gelen iki şirket temsilcisi, köye gelerek projenin detaylarını aktarır. Bu tatil tesisi planı, hem bölgenin ekolojik dengesini hem de köylülerin yaşam biçimini tehlikeye atacak niteliktedir. Durumun farkına varan Takumi ve Hana, köylerini ve yaşam tarzlarını korumak için mücadele etmeye karar verirler.