Kötülüğün Kökeni, Zengin ve prestijli bir ailenin genç ve güzel üyesi olan Stéphane, annesinin geçirdiği bir kazanın ardından aile malikanesine geri döner. Annesinin iyileşme sürecine yardımcı olmak için eve gelen Stéphane, zamanla ailenin içindeki karanlık ve gizemli bir atmosferin olduğunu fark eder. Aile üyeleri arasındaki gergin ilişkiler, geçmişte yaşanan trajik olaylar ve birbirlerine karşı duydukları derin güvensizlik, Stéphane'i giderek daha fazla rahatsız eder. Stéphane, ailesi hakkında daha fazla bilgi edinmeye çalışırken, geçmişte yaşanan korkunç bir olayın izlerine rastlar. Bu olay, ailenin tüm üyelerini derinden etkilemiş ve aralarındaki bağları zedelemiştir. Stéphane, ailenin sırlarını ortaya çıkarmaya yaklaştıkça, kendisi de tehlikeli bir oyunun içine çekilir.
