Adaya ulaşan grup, adanın, insanoğlunun hayal bile edemeyeceği bir dünya olduğunu keşfeder. Ada, dev dinozorlar ve diğer devasa yaratıklarla doludur. Grup, adanın yerlileri olan ve Kong olarak bilinen dev bir goriller tarafından da karşılanırlar. Kong, adanın koruyucusudur ve grubun adadan ayrılmasını istemez. Grup, adadan kaçmak için Kong ile savaşmak zorunda kalır. Ancak, Kong'un gücü karşısında çaresizdirler.
Kong Kafatası Adası, sürükleyici ve görsel olarak etkileyici bir film. Film, devasa yaratıklarla dolu bir adanın, insanoğlu için ne kadar tehlikeli olabileceğini ve insan ve doğa arasındaki ilişkiyi araştırıyor.